基因组中心成立于2008年4月，实验室占地1000多平方米，拥有国际一流的高通量测序等科研设备。主要研究领域包括人类疾病基因组学、人类第二基因组分析和开发、比较细菌基因组学、沙门菌的分子进化、人畜共患病感染因子宿主适应性的遗传学基础、天然抗癌药物研发等。在国际上首次提出界定细菌天然物种的客观参数，以及细菌进化的“Adopt-Adapt模型”和“遗传开关”理论。目前工作重点是医学基因组学和天然药物研发项目，利用第二代测序技术平台，开展肿瘤基因组学、转录组学及放线菌研究。由刘树林教授带领的毕业于北京大学、协和医科大学、哈尔滨医科大学的多位年轻精英组成的团队现已承担国家自然科学基金项目10余项（包括重点、面上和青年项目），以及博士点基金项目等多项其他的国家和地方基金。 发表科研文章150余篇，包括SCI期刊文章100余篇。关于HIV疫苗以及人体肠道菌群天然抗癌活性等方面申请专利4项。基因组中心还与哈医大附属医院、北京大学、美国癌症研究所、加拿大卡尔加里大学等国内外多所科研单位建立了密切的合作关系，并分别于2011年、2014年和2016年举办多次大型国际会议，邀请国际专家数十人参会。